Die junge Liko verlässt ihr Zuhause Paldea, um in Kanto an der Indigo-Akademie zur Pokémon-Trainerin ausgebildet zu werden. Dort trifft sie auf ihre Mitbewohnerin Ann und erhält das Pokémon Felori als Partner. Nach anfänglichen Schwierigkeiten entwickelt sich eine tiefe Bindung zwischen Liko und Felori.
Doch eines Tages wird Liko von einem geheimnisvollen jungen Mann besucht, der ihr Misstrauen durch sein Interesse an ihrem Anhänger weckt.
Eine riesige Energiewolke bewegt sich auf die Erde zu. Unter dem Kommando von Captain Kirk soll das Raumschiff „U.S.S. Enterprise“ das gefährliche Phänomen untersuchen.
Die Erde ist in Gefahr, mehrere Raumschiffe und eine Raumstation wurden bereits zerstört. Im Inneren der Wolke scheint sich eine Intelligenz zu befinden, die konkrete Ziele verfolgt.
Der erste Kinofilm der erfolgreichen... Star Trek: Der Film